遺傳圖譜構建和QTL定位
遺傳圖譜也叫連鎖遺傳圖譜(Genetic linkage map),是以基因或者遺傳標記之間的連鎖和重組交換值構建的圖譜。QTL 定位是通過對遺傳標記與性狀之間相關性的分析,將一個或多個QTL 定位到染色體的遺傳標記之間。 康普森提供基于基因芯片和高通量測序的高密度遺傳圖譜構建及QTL 定位服務,助力重要育種價值基因的挖掘。
Sample requirements
材料準備
首先需要構建作圖群體進行高質量遺傳連鎖圖的繪制,然后測定作圖群體中不同個體或株系的標記基因型;對標記基因型數據進行連鎖分析,構建標記連鎖圖。然后將QTL定位在遺傳圖譜上,確定QTL與遺傳標記間的距離(以重組率表示)。
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作圖群體
臨時作圖群體:F1、F2、BC等永久作圖群體:RIL、NIL、DH等 - ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
分子標記
SSRSNP - ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
模型選擇
區間作圖法 IM復合區間作圖法 CIM多重區間作圖法 MIM
Schematic diagram
技術示意圖
結果展示
文章使用Affymetrix 小麥 660K SNP 芯片對六 倍體小麥進行檢測。由此得到全長4424.4 cM 包含 11566 個標記的高密度遺傳圖譜,其中119001 個位 點為SNP 標記。
◎ Cui, F. , Zhang, N. , Fan, X. L. , Zhang, W. , Zhao, C. H. , & Yang, L. J. , et al. (2017). Utilization of a wheat660k snp array-derived high-density genetic map for highresolution mapping of a major qtl for kernel number. Scientific Reports, 7(1), 3788.