全基因組關聯分析
GWAS(Genome-wide association study)，即全基因組關聯分析，是通過掃描基因組中數以百萬計的單核苷酸多態性（single nucleotide polymorphism, SNP）分子標記，進行基因型和表型間相關性分析，篩選出影響復雜性狀的基因變異的一種策略。
多性狀定位
在全基因組水平上同時且廣泛地挖掘與多個目標性狀變異顯著相關的多個基因。
生物學基礎研究
在全基因組水平上同時研究一個代謝路徑或通路上的多個性狀。
群體進化研究
將GWAS與群體進化結合分析定位性狀關鍵基因。-
研究趨勢
· 與群體進化相結合· 與QTL 定位結合· 基因組檢測數據重復利用
Schematic diagram
技術示意圖
Results Display
結果展示
- 關聯分析 / ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?曼哈頓圖為經F檢驗的全基因組P值按染色體上物理位置排序圖，橫坐標為基因組坐標，縱坐標-log10P，P值越小縱坐標越大關聯性越強。 - 群體主成分分析 / ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?主成分分析（PCA）是一種數學的運算方法，基于個體基因組SNP差異程度，可以將多個相關變量經過線形轉換選出較少個數的重要變量。 - 構建單體型圖譜 / ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?利用全基因組SNPs構建單倍型圖譜，可以分析顯著關聯SNP位點之間、候選基因內各SNP位點之間的LD關系以及單體型和性狀之間的相關性。